A tecnologia de eletroforese de gel bidimensional e a tecnologia de espectrometria de massa são atualmente os métodos mais utilizados para estudar proteômica. A tecnologia de eletroforese de gel bidimensional usa ponto isoelétrico de proteína e diferença de peso molecular para distinguir várias proteínas. Embora seja difícil distinguir proteínas de baixa abundância por eletroforese de gel bidimensional, ela tem requisitos mais elevados para operação, mas sua alta produtividade, boa resolução e reprodutibilidade, e suas características de ser combinado com espectrometria de massa fazem dele os métodos de pesquisa proteômica mais populares e confiáveis. A tecnologia de eletroforese de gel bidimensional e os procedimentos de pesquisa de proteômica baseada em espectrometria de massa são a preparação →esoelétrica→polyacrylamida gel eletroforresis→gel stain →discção de pontos proteicos de →in-gel digestão→mass análise de espectrometria para determinar peptídeos Impressão digital ou banco de dados de sequência de aminoácidos parciais→use para determinar proteína. A pesquisa de proteômica requer separação de proteínas de alta resolução e técnicas precisas e sensíveis de identificação de espectrometria de massa. A coloração de proteínas na eletroforese em gel não afeta apenas a resolução da separação de proteínas, mas também afeta a identificação subsequente da espectrometria de massa. A coloração proteica pode ser dividida em quatro categorias: coloração orgânica de reagentes, coloração de prata, coloração fluorescente e coloração de isótopos.
Unlu et al. propuseram um método de análise de proteômica quantitativa de fluorescência (F-2D-DIGE). A eletroforese de gel diferencial (DIGE) é uma melhoria técnica de 2-DE. Combina o método de análise de fluorescência múltipla. Separa várias amostras rotuladas com fluorescência diferente no mesmo gel e introduz o conceito interno O conceito subjacente. As proteínas nas duas amostras são misturadas com diferentes rótulos fluorescentes para realizar 2-DE para detectar a expressão da proteína nas duas amostras, o que melhora muito a precisão, confiabilidade e repetibilidade dos resultados. Na tecnologia DIGE, cada ponto de proteína tem seu próprio padrão interno, e o software pode calibrar automaticamente sua expressão de acordo com o padrão interno de cada ponto de proteína para garantir que as alterações de abundância de proteínas detectadas sejam verdadeiras. A tecnologia DIGE foi aplicada em várias amostras.